红色警报！敌人侵入母舰，萨姆斯投入战斗：

　　＊C键变成球体移动；Z键调整为射击视角；准星变红为攻击瞄准。

　　1.从Flag Bridge中出来后按原路返回，从驾驶室下方右侧的舱门进入，一路上会消灭6个敌人，然后在无路可走时进入“Xenoreserch Lab”。在Xenoreserch Lab中会出现3个敌人，他们将能量细胞取了下来。玩家只要守住两边的通道，在上层稳定射击就可获胜。

　　2.获胜后将能量细胞放入刚刚被敌人取出的机关中，顿时从四面八方涌出来许多幼小的异形生物体，打是打不完的，赶紧变成球一统乱滚，然后从破损的地面滚落到下层从舱门中逃离。出来后是通风管道，继续顺着通道滚动前行，中途可获得能量罐，然后在通道尽头按A键使用炸弹将自己炸上高台通过。

　　3.从通风管道滚落到一条绿河中，变回人形，对前方的图案进行扫描，然后来到门前变成球形使用炸弹弹上通道，在通道中按住A键不松使用能量罐，冲出飞船。

　　4.萨姆斯变回人形，从飞船底部潜入母舰。开门进入后一路向上，遇到断层连续按B键使用二段跳，消灭不断出现的敌人，从飞船的上方跳过到达对岸获得导弹。回到一层按右手柄十字键下使用导弹将角落的障碍炸开，出现掌纹仪，比对成功后打开大门。

　　5.进门后瞄准对岸门上的四个小红点进行射击，成功后桥会出现，但是通过前还要消灭敌人组成的盾墙，只有射击变红的敌人才能将其消灭。过桥后左方舷梯处有一记录点，前方的大门处有掌纹仪，通过后终于见到了自己的飞船。

　　6.萨姆斯向飞船奔去，不料游戏的第一个BOSS出现。先对其进行扫描，然后射击BOSS肩膀上的红光处，然后BOSS会放出紫色的能量球进行反击，瞄准能量球射击将其反弹回去，重复多次后BOSS头顶的弱点就会暴露出来，此时再瞄准BOSS头顶的红色区域进行射击就可伤害到它了。对于BOSS的攻击建议使用绕圈跑结合二段跳进行躲避，另外有效击中BOSS时也会有回复道具掉下供玩家补充。